武汉新港建设投资开发集团有限公司的前身为武汉交通国有控股集团公司，于2000年7月组建。2009年8月，为实施国务院批准的打造武汉新港——中国最大内陆河港口这一宏伟战略，按照武汉市委、市政府要求，正式更名为武汉新港建设投资开发集团有限公司，为主要从事国有资产运作、产权经营和武汉新港基础设施建设、投融资、经营管理的市属国有独资企业。
目前集团公司本部及司属各企业坚持以科学发展为统领，把发展作为第一要务，紧紧抓住武汉“两型社会”建设、武汉新港建设和国家建立长江中游航运中心等机遇，大力推进企业改革改制、结构调整、资产重组，转变经济发展方式，在公路客运、水上运输及现代物流方面形成了自己的特色。其中，湖北公路客运集团以900余辆各类豪华客车，830余条客运线路，成为华中地区屈指可数的客运“航母”，正在筹备上市;湖北汽运总公司拥有运输车辆17000辆，已形成广覆盖、多领域的数个物流基地，规模位居湖北第一;华中航运集团拥有江海直达和特种运输船舶近百艘，已成为湖北省同行业集单船吨位最大、占有吨位最多和综合运输能力最强的水上运输企业，2010年7月，六艘万吨巨轮扬帆起航，改写了长江中游万吨巨轮不能通航的历史;武汉大通出租车公司以1300余辆的出租车坐上了湖北省出租车行业的“第一把交椅”;武汉大通实业公司在7月9日成功开启的汉台货运直航，更是为两地物流合作提供了新的交流平台。
2010年，集团公司开始履行新港建设的职能，全面启动阳逻集装箱码头第三作业区一期工程、武汉新港长江城、武汉航运中心大厦等武汉长江中游航运中心三大项目建设，并立志在“十二五”期间成为在国内同行业中有一定知名度，在华中地区有重要影响力的现代大型综合性企业集团，进入中部一流企业行列。